Till institutets forskningsområden hör antikens och medeltidens historia, klassisk filologi, arkeologi och konsthistoria, liksom annan humanistisk forskning med Italien i fokus.
Direktörens och forskarlektorns forskningsprojekt har en central ställning inom forskningsverksamheten.
Stiftelsen som driver Finlands Rom-institut stöder forskare i olika karriärskeden genom att bevilja stipendier för forskning i Rom.
Institutet publicerar också en vetenskaplig publikationsserie, Acta Institututi Romani Finlandiae, och har ett vetenskapligt bibliotek i Villa Lante.
Institutet bidrar till populariseringen av vetenskap bland annat genom sin podcast Parlatorio och bloggen Fenestra Finnorum (på finska).